国际临床病毒学杂志

研究文章

2014伊波拉病毒模型:西非证据

NadhemSelmi*

量化方法系突尼斯Sfax经济管理学院

通讯通讯地址Nadhem Selmi量化方法系Sfax经济管理学院电话:(+216)2170462电子邮件:nadhem.selmi@yahoo.fr

日期 :提交者:2019年4月15日核准数 :2019年5月01日发布日期:2019年5月2日

如何引用此文章塞尔米2014伊波拉病毒模型:西非证据intJClinVirol20193:010-015DOI:10.29328/journal.ijcv.1001004

版权使用量 :2019Selmi必威体育西汉姆联允许媒体不受限制使用、分发和复制, 前提是原创作品正确引用

关键字 :埃博拉2014几内亚机长

埃博拉病毒无法通过气波传播,而是与受感染体液密切直接接触:血液、凳子和呕吐物据WHO称,病毒痕迹可能存在于母乳、尿液和精液中盐水、眼泪和汗水风险极低WHO表示病毒通过咳嗽喷嚏传播为“稀疏或几乎不存在”。埃博拉病毒还可以在接触受染物或液体污染的表面期间或之后传播,如床单和服装等卫生工作者可能受伊波拉病毒感染护理一次对人的污染,如果抗感染措施没有得到严格执行的话。

受感染者不具有传染性,只要他不显示埃博拉病症状病毒孵化周期持续2至21天不等受感染者仍会传染,因为病毒存在于血液和体液中举例说,病毒可能保留在恢复人精子中至少70天卫生组织还建议高度警惕与受感染死尸直接接触

值得一提的是,WHO提倡严格卫生措施和风险因素认知以限制伊波拉病毒向人类传播手套和个人保护安全设备推荐处理伊波拉病人以避免接触体液医院访问病人后和提供家庭护理后洗手至关重要。

限制病毒暴发,WHO建议快速安全掩埋死尸,严格识别可能接触伊波拉受感染者的问题,并监控至少21天

除基本卫生外,保健提供者在处理伊波拉感染时需要采取特别措施,如穿呼吸器、防水袍、双手套、护目镜、帽和防水套,所有这些都应可一次性处理。也可用密封整体组合替换这类设备病人应穿一次性睡衣和外科面罩病人案例确认后,应放入合适的单机缺区医疗垃圾(传染病护理活动)必须焚化

野鸟群理解AI动态很容易通过使用模型来评估和整合实验室、实验和现场研究提供的不同科学数据此外,疾病系统相关模型大可帮助评估替代管理策略的潜在有效性,识别知识中的重大空白,并判定系统不同构件的相对重要性。SEIR模型(可感知、显露、感染和恢复)提交帮助检查单鸟埃博拉感染相关动态埃博拉病毒通过鸟对鸟接触或通过周围环境传播受感染鸟接触后会接触或受感染潜值期间,AI病毒在宿主内部开发直到后端通过切除病毒成为传染性(I)。埃博拉病毒优先复制胃肠道并排出高层次粪便对比之下,最近在西非以病毒为主,特别是自2002年以来隔离的埃博拉病毒主要复制到野鸭上呼吸道归根结底宿主会恢复或死取决于其免疫系统与病毒之间的交互作用(表1)。

埃博拉传播模型

SEIR型传播模型[1、2],该模型计及在主文描述的西非伊波拉病毒暴发期间不同干预阶段通知症状个体隔离和时间依赖传播率先前开发相似区块模型研究SARS传输动态和1918大流行[3,4]

图表示个人流 $\mathrm{辰族}\frac{\mathrm{一号}}{\mathrm{N级}}$传输速率易感性S级发自一E级受感染者(尚非传染性)类个人;K级速率E-个人移入表征和传染类一脱机传染性个人一)死或恢复率南锥体.一非流行病学状态,但跟踪症状发端后案例累积数

关于模型(图1),人口划分为五五类个人,即:可感知性(S)、显露性(E)、感知性与传染性(I)、孤立和局部传染性(J)和恢复式(P)。症状感染者或隔离型(J类)通知后按a速率恢复或不诊断/报告率恢复南锥体微量感染隔离个体被假设为局部传染性,隔离策略有效性根据可用数据估计,如下参数估计段所解释机组总规模(N=342)假设不变并初始易染伊波拉病毒外加混合机组每个人与集团内任何其他人接触的概率相同部分由于小人口环境以及缺乏分析由单个级或年龄组组成人数相对较少的乘员的必要统计能力,这一假设得到推进。最后,人们假设以前的埃博拉疫苗接种对病毒传播没有影响,因为先前的数据表明2014年大流行前使用的埃博拉疫苗几乎没有防埃博拉病毒[5]

可感知机组成员受病毒感染后可按速率访问潜段(E类)et)i+lJ去哪儿DE(t)表示平均日间传输率初始传输速率辰族_一号)并改成3月22日实施并开始对几内亚生效辰族₂干预期间(即辰族₂<辰族_一号干预有效时)比率I(t)+lJ(t)/N表示在总人口规模N中与受感染个体接触的概率个人向传染类和表征类的潜在进度速率 $\mathrm{百货公司}$高山市 $\frac{\mathrm{一号}}{\mathrm{百货公司}}$表示平均潜值)平均传染周期由 $\frac{\mathrm{一号}}{\mathrm{南锥体}}$.恢复个人假设受保护,尽管流行病持续时间长用于描述上述传输过程的确定式模型由 :

$\begin{array}{l}\frac{\mathrm{d级}\mathrm{S级}}{\mathrm{d级}\mathrm{t级}}=-\mathrm{辰族}高山市\mathrm{t级})\mathrm{S级}高山市一+\mathrm{I级}\mathrm{J大全})/\mathrm{N级}\\ \frac{\mathrm{d级}\mathrm{E级}}{\mathrm{d级}\mathrm{t级}}=\mathrm{辰族}高山市\mathrm{t级})\mathrm{S级}高山市一+\mathrm{I级}\mathrm{J大全})/\mathrm{N级}-\mathrm{百货公司}\mathrm{E级}\\ \frac{\mathrm{d级}一}{\mathrm{d级}\mathrm{t级}}=\mathrm{百货公司}\mathrm{E级}-\mathrm{南锥体}一-\alpha 一\\ \frac{\mathrm{d级}\mathrm{J大全}}{\mathrm{d级}\mathrm{t级}}=\alpha 一-\mathrm{南锥体}\mathrm{J大全}\\ \frac{\mathrm{d级}\mathrm{P级}}{\mathrm{d级}\mathrm{t级}}=\mathrm{南锥体}高山市一+\mathrm{J大全})\end{array}$

并

哪里t_{July_5th_intervention}即3月22日大规模公共卫生措施生效日普通微分方程系统通过Matlab解决数值问题

随机模拟流行病

关键是要考虑随机性模型比确定性模型模拟,因为与小群相关联的随机性较高,例如那些被困在军舰中者就是这种情况。正因如此,从 Poisson模拟法[6]中推导出与上述模型有关的随机流行病认识,该模拟法以上述确定性模型为基础此外,暴发分布大小也被调查成反应控制干预时间和强度函数

复制号

基本复制号R₀)被定义为初级传染案例生成的二级案例数在整个传染期间完全易受感染人群内和无控制干预[7-10]时间段R₀)大于一,传播可导出并可能导致实际流行公共卫生干预的一个主要目标在于将这一规模减到比尽快低一图实用量表示有效复制数R说明易感性变化复制数字有助于确定控制流行病所需的干预强度[2]

流行病学参数估计后,复制数可以通过插入估计参数值插入复制数公式估计模式复制数公式可表示为船舶中尚未通知的表征和感染者(I类)和隔离部分传染者(J类)对感染作用之和

传染性但尚未通知个人复制号的提供方式如下:

$R^{\mathrm{s级}\mathrm{y市}m\mathrm{公元前}\mathrm{t级}\mathrm{欧市}m\mathrm{a/}\mathrm{t级}一\mathrm{C级}}=高山市\mathrm{T级}R\mathrm{a/}\mathrm{N级}\mathrm{s级}m一\mathrm{s级}\mathrm{s级}一\mathrm{欧市}\mathrm{N级}\text{速率})*高山市\mathrm{M级}\mathrm{e类}\mathrm{a/}\mathrm{N级}\text{infections period})$

偏离和局部感染者对复制数的贡献由以下部分提供:

$\begin{array}{l}{R}^{一\mathrm{s级}\mathrm{欧市}\mathrm{I级}\mathrm{a/}\mathrm{t级}\mathrm{e类}\mathrm{d级}}=高山市\mathrm{F级}R\mathrm{a/}\mathrm{C级}\mathrm{t级}一\mathrm{欧市}\mathrm{N级}\text{of Symptomatic and infectious cases that are isolated})\\ *高山市\mathrm{T级}R\mathrm{a/}\mathrm{N级}\mathrm{s级}m一\mathrm{s级}\mathrm{s级}一\mathrm{欧市}\mathrm{N级}\text{速率})*高山市\mathrm{内置}\mathrm{I级}\mathrm{a/}\mathrm{t级}一\mathrm{V级}\mathrm{e类}\text{infectiousness of isolated individuals})\\ *高山市\mathrm{M级}\mathrm{e类}\mathrm{a/}\mathrm{N级}\text{infectious period})\end{array}$

整体复制数取自:

$R=R^{\mathrm{s级}\mathrm{y市}m\mathrm{公元前}\mathrm{t级}\mathrm{欧市}m\mathrm{a/}\mathrm{t级}一\mathrm{C级}}+R^{一\mathrm{s级}\mathrm{欧市}\mathrm{I级}\mathrm{a/}\mathrm{t级}\mathrm{e类}\mathrm{d级}}$

参数估计

平均潜值固定为1.5天,平均传染周期根据伊波拉病毒流行病学2至3天受约束[11至12]从发症到通知或通知率的平均时间α依据几内亚和利比里亚实验室确认埃博拉病毒报告案例通知延迟经验分配确定为1/1.6天简单传播率和隔离策略有效性变化量化模式适应伊波拉病毒案例曲线日期启动流行病学参数估计后使用这些参数生成估计R使用从传输模型推导出公式

传输率辰族^一号和BET²),隔离个体相对传染性E级和传染一高山市0类别估计模型最少适配日新伊波拉病毒例数短期隐型伊波拉特征[9]E级0)=一0)简单化让我们只能估计四大参数 从时间序列 实验室确认埃博拉病毒例复制数使用3月22日几内亚开始强化控制干预和3月29日利比里亚开始强化控制干预前相联数据估计

不确定性分析

我们估计模型参数的不确定性与前期研究时一样[4,10]简言之,我们模拟了100次异位实现流行病轨迹,干扰每日最适量新埃博拉病例曲线最适配曲线中添加模拟误差结构j大全天之灵j+1Poisson表示新案例数j大全至j+1区间 。95%套接机复制数应解释为包含95%估计值,如果分析用同模型假设重复并观察错误是唯一噪声源

模型捕捉到伊波拉病毒疾病的动态性,包括接触受污染针头和人际传播造成的感染,以及结果的定时通过安装多时序列,我们能够联合估计若干关键流行病学参数(表2和图1)。使用这些估计,我们计算R按表3

95%可信比例复制数 西非伊波拉病毒暴发基于接连贝叶斯估计SEIR法敏感度分析假设负二分分布估计基于2014年3月22日控制干预启动前的流行病学数据

关于交费者注解

Nadhem Selmi突尼斯Sfax大学抗衡方法博士研究兴趣主要在于西非金融危机、长存储过程、GARCH进程和伊波拉病毒的传播